| Tuberculose | Tosse crônica, emagrecimento, imagem pulmonar, lesão laríngea, linfonodo cervical. Diferencial mais importante e coinfecção mais frequente. | BAAR e teste molecular no escarro; apical cavitário × intersticial bilateral; buscar o fungo mesmo com TB confirmada. |
| Histoplasmose | Febre, disseminação, linfonodos, pulmão e mucosa; reação cruzada sorológica. | Levedura pequena intracelular sem brotamento múltiplo; antígeno urinário e cultura; pensar sempre em HIV avançado. |
| Blastomicose e coccidioidomicose | Quadro pulmonar e cutâneo semelhante. | História geográfica; brotamento único de base larga (blastomicose), esférula (coccidioidomicose). |
| Esporotricose e lobomicose | Lesões cutâneas nodulares e ulceradas, às vezes linfangíticas. | Esporotricose: padrão linfocutâneo ascendente e contato com gato. Lobomicose: lesões queloidianas crônicas na Amazônia. |
| Actinomicose | Lesão cervicofacial supurativa com fístula. | Grãos actinomicóticos, bactérias filamentosas Gram-positivas; resposta à penicilina. |
| Leishmaniose tegumentar e mucosa | Úlcera mucosa nasal e oral destrutiva em paciente rural. | Pesquisa direta e PCR para Leishmania; lesão nasal com perfuração septal. |
| Hanseníase e sífilis | Lesões cutaneomucosas crônicas e infiltrativas. | Baciloscopia e avaliação de troncos nervosos; testes treponêmicos e não treponêmicos. |
| Linfoma (Hodgkin e não Hodgkin) e leucemia | Febre, linfonodos generalizados, hepatoesplenomegalia e emagrecimento no jovem. | Biópsia com imuno-histoquímica — pedir pesquisa de fungos no mesmo material. |
| Neoplasia de pulmão, boca ou laringe | Úlcera crônica em tabagista, massa ou nódulo pulmonar. | Biópsia com histologia completa; as duas podem coexistir na mesma lesão. |
| Granulomatose com poliangiíte | Lesão destrutiva de via aérea superior + pulmão. | ANCA, acometimento renal, vasculite na histologia, ausência de fungos. |
| Sarcoidose | Granulomas, adenomegalia e infiltrado pulmonar. | Exclusão infecciosa, linfonodos hilares simétricos, granuloma sem necrose nem agente. |
| Farmacodermia | Erupção polimorfa, às vezes com febre e adenomegalia. | Relação temporal com fármaco, melhora após suspensão, sem fungo na histologia. |